马蹄最常见的保存方法就是将其置于阴凉通风处保存，但是注意不要下水清洗，建议保留外皮上的泥土，因为泥土也可以保护马蹄，在一定程度上延长保存时间，另外，还要注意避免潮湿，否则会导致马蹄迅速腐烂长霉，一般这种保存方法可以存放半个月左右。
2、冰箱冷藏保存
马蹄中含有大量的水分及糖类物质、淀粉等，在一定的温度条件下容易滋生细菌而腐烂变质，而冰箱中的低温环境可以抑制细菌的滋长，延长马蹄的保存时间，因此如果马蹄的量不是很多的话，可以选择冰箱冷藏保存。
3、风干储存
马蹄中含有较多的水分及糖类物质，所以容易腐烂变质，如果将水分晒干或烘干，也可以帮助延长马蹄的保存时间，因此建议可以将马蹄放在干燥通风或阳光下晾晒几天，稍风干水分之后再装入干净的袋子中保存即可，一般这样的马蹄甜度会更高，但是吃起来可能不会那么脆嫩。
4、真空保存
如果有条件的话，也可以用真空机保存马蹄，这种方法不仅可以保持马蹄的新鲜度，还可以避免水汽进入，延长马蹄的保存时间。